Après l'obtention de son diplôme en génie électrique de l'Université de Sherbrooke, en 1975, M. Chouinard travaille cinq ans à la planification du service de radiodiffusion par satellite (SRS) pour la Société Radio-Canada, dans le secteur des relations techniques internationales. En 1981, il entre à la Division de la technologie spatiale du Centre de recherches sur les communications (CRC), où il continue de travailler sur les aspects techniques et l'exploitation de l'orbite et du spectre dans le contexte du SRS.

En 1986, il rejoint la nouvelle Direction Générale des technologies de radiodiffusion du CRC comme gestionnaire en recherche sur les systèmes de radiodiffusion. En mai 1992, il accepte le poste de directeur de la recherche sur les systèmes de radiodiffusion et les réseaux de communication après en avoir assuré l'intérim pendant un an.

Après une restructuration au CRC en avril 1993, il dirige la recherche sur les technologies de radiodiffusion jusqu'en avril 1998, date à laquelle il devient le conseiller principal du président pour les questions de radiodiffusion. En 2001, il est détaché à la Direction Générale de l'ingénierie du spectre d'Industrie Canada jusqu'à ce qu'on lui propose son poste actuel de gestionnaire principal du programme d'accès large bande en régions rurales et éloignées au CRC.

Durant sa carrière, M. Chouinard a étroitement collaboré à l'élaboration de normes pour la télévision de pointe et les systèmes de radiodiffusion sonore numériques. Il a aussi été actif sur la scène internationale en représentant le Canada auprès du Bureau des radiocommunications de l'Union internationale des télécommunications (UIT) et en participant à WorldDAB. En Amérique du Nord, il a participé aux travaux de l'Advanced Television Systems Committee et du comité consultatif de la Federal Communications Commission américaine sur la télévision de pointe ainsi qu'à ceux du Digital Audio Radio Committee de l'Electronics Industries Association sur la normalisation de la radiodiffusion sonore numérique. Au Canada, il fait partie de la branche nationale de l'UIT-R et du Comité technique conjoint sur la radiodiffusion de pointe. M. Chouinard a publié plusieurs articles et donné de nombreux exposés sur ces sujets.

Il est maintenant étroitement impliqué dans le développement de la norme pour réseaux régionaux sans-fil sous l'égide de l'Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE) entrepris par le groupe de travail 802.22 dont il est le vice-président.